La malagueta tiene un sabor picante y un aroma distintivo, y se usa en salsas, marinadas, y como condimento para añadir un toque de calor a los platos. A menudo se encuentra en forma de pasta o en polvo en la cocina brasileña y en la comida caribeña.
Además de su uso culinario, la malagueta tiene propiedades antioxidantes y puede tener beneficios para el sistema digestivo. Sin embargo, su consumo debe ser moderado debido a su alta intensidad de picante.